I sintomi della meningite B sono simili a quelli delle altre forme di meningite batterica.
All’inizio i sintomi possono essere aspecifici, quali sonnolenza, inappetenza, nausea e vomito, e possono essere confusi con i sintomi tipici di una semplice infezione virale.
Solitamente, in caso di meningite batterica compaiono febbre, mal di testa e rigidità al collo, spesso accompagnati da letargia, torpore o convulsioni.

Nei neonati e nei bambini piccoli i sintomi classici della meningite (febbre, mal di testa, rigidità al collo) possono essere assenti o difficile da identificare.
Solitamente i bambini piccoli presentano vomito o inappetenza e si mostrano inattivi e irritabili. Inoltre è possibile osservare un gonfiore sulla testa, in corrispondenza della fontanella (area “membranosa” della testa del bambino in corrispondenza della quale le ossa craniche non si sono ancora saldate) e riflessi alterati.